JAX框架驱动AI蛋白质工程革命:Escalante实现3.65倍成本效益提升

🎯 情报来源:Cloud Blog

AI初创公司Escalante利用JAX框架开创性地将AlphaFold 2等12个蛋白质预测模型整合为统一优化系统,在药物设计领域取得突破性进展。通过构建多目标可微分函数,其Mosaic平台能将随机蛋白质序列进化为满足结合亲和力、溶解度等复合特性的新型结构,单次可生成1万-5万个候选设计,最终仅需湿实验验证10个最优方案。

技术实现上,Escalante采用2000-4000个TPU v6e(Trillium)集群进行半小时级爆发式计算,相较H100 GPU实现3.65倍的每美元性能提升。其核心工具库Mosaic已开源,包含基于JAX重构的Boltz-2结构预测模型等关键组件。

💡 核心要点

  • 模型整合:12个蛋白质预测模型(含AlphaFold 2)通过JAX整合为统一优化系统
  • 计算规模:单次任务调用2000-4000个TPU,生成1万-5万候选蛋白质设计
  • 成本优势:TPU v6e比H100 GPU节省65%计算成本(3.65x性能/美元)
  • 实验效率:湿实验验证量压缩至10个/批次,筛选效率提升500-5000倍
  • 技术栈:深度依赖JAX生态(Equinox/Optax)+Google Kubernetes引擎

📌 情报分析

技术价值:极高 – 首次实现多模型蛋白质设计的端到端可微分优化,突破传统生物工程方法论

商业价值:高 – 人类蛋白质组计划级算力需求将推动TPU市场增长,但医疗应用商业化周期较长

趋势预测:极高 – JAX在科学计算领域市占率将持续提升,2025年或成计算生物学标配框架

原文连接

0 条回复 A文章作者 M管理员
    暂无讨论,说说你的看法吧
个人中心
今日签到
有新私信 私信列表
搜索